네이버 뉴스를 기웃거리다가
생물정보학으로 천식 유발 후보 유전자 찾았다 라는 기사를 보고 이건 또 뭐야! 하면서 기사를 클릭했더니 요즘 꽤나 흥미를 가지고 있던 바로 질병 네트워크에 관한 논문의 기사였다. 뭐~~
A protein interaction network associated with asthma more..
OMIM, GEO에서 천식 관련 단백질 606개 찾고, 단백질 사이의 상호작용(PPI)를 네트워크화 해보니까 269개는 하나씩 분리되고 337개는 269개가 서로 연결되어 cluster 형성하는 등 28개의 cluster가 연결되어 네트워크를 형성
허브 역할 , 클러스터간 연결고리 역할을 하는 천식 유발 후보 유전자 7개(SRC, CREBBP, MAPK1, GNB2L1, VAV1, CBL, BRCA1) 이 중 3개는 (SRC, CREBBP, MAPK1) 기존 연구에서 천식과의 관련성이 있는것으로 밝혀짐(pubmed)
아직 논문을 보지 못했지만,, 지금까지 전체 네트워크에 대한 overview 논문에서 특정 질병을 target으로 했다는것,,, 이전 포스팅에서 asthma 이야기가 나왔었는데, 이런 유연의 일치가 ^^;;
supplementary material이 작동을 하지 않는다. gene 전체 리스트와 분석한것이 들어있다는데,,,
Posted by hongiiv